Строительство Ильинской церкви датируется 1690-1696 гг. В изданиях XIX - начала XX веков годом постройки называется 1696 (ссылка на Памятную книжку Новгородской губернии за 1916 г. Новгород, 1916. С. 235.). В 1940-е появляется более ранняя дата - 1690 год (Забелло С., Иванов В., Максимов П. Русское деревянное зодчество. М., 1942. С. 170.). В работах последнего десятилетия можно встретить как раннюю (Добровольская Э. Д. (автор-составитель). Памятники народного деревянного зодчества России в творчестве Бориса Гнедовского. М., 2000. С. 46.), так и сравнительно позднюю датировку (Рыбаков Александр. Вологодская икона. М., 1995. С. 32.), но без каких-либо ссылок на соответствующий исторический источник…. Никаких письменных источников конца XVII в., сообщающих о сооружении Ильинской церкви, пока не найдено - вероятно, они не сохранились. Но в XIX в. в самом храме еще находилась благословенная грамота на его постройку. Сведения об этом содержит документ середины столетия, в нем же фрагментарно пересказывается и содержание благословенной грамоты. Документ озаглавлен «Историко-статистическое описание церквей... Покрова Божией Матери и ... Святаго Славнаго пророка Божия Илии, находящихся в Городе Белозерске», составленное священником Покровской церкви Андреем Светловым: «Построена оная церковь в 1696 году при государе Петре I Алексеевиче, с благословения преосвященного Гавриила Архиепископа Вологодского и Белозерского, на месте пребывшей во имя Покрова Божией Матери, от многолетия обветшавшей, построена иждивением прихожан...». Описание церквей Покровской и Ильинской в городе Белозерске [сер. 1850-х - начало 1860-х годов]. Л. 4). По свидетельству священника Андрея Светлова, благословенная грамота хранилась в самой Ильинской церкви.

Карта: